Nieuwe technieken en moderne zorg stelden andere eisen aan ziekenhuizen. Aan het einde van de jaren tachtig werd duidelijk dat Sint Joep niet meer kon meegroeien met de toekomst.
Uiteindelijk verhuisde de zorg naar een modernere locatie in Veldhoven en verdwenen de gebouwen aan de Aalsterweg. Het ziekenhuis zelf bestaat niet meer, maar de herinneringen zijn gebleven. Voor veel Eindhovenaren was Sint Joep meer dan een gebouw van steen en beton. Het was een plek waar levens begonnen, waar verdriet en hoop elkaar ontmoetten en waar duizenden persoonlijke verhalen samen één grote geschiedenis vormden.
In 1991 werd het gebouwencomplex gesloopt, nadat het ziekenhuis verplaatst was naar Veldhoven. In 2002 fuseerde het met het Diaconessenhuis tot het Máxima Medisch Centrum (MMC).